Promovendus ontregelen van de tuberculose-bacterie

Mycobacterium tuberculosis heeft een ondoordringbare celwand. Om deze celwand te functionaliseren, beschikt de bacterie over vijf verschillende eiwitsecretiesystemen, ook wel ESX-systemen genoemd. Sommige van deze systemen zijn essentieel voor de groei of virulentie van de bacterie. Van ESX-4 weten we echter nog maar weinig.

Onlangs hebben we ontdekt dat de aanmaak van dit systeem nauwkeurig wordt gereguleerd door het peptide WerA en de regulator WerB. Het uitschakelen van deze eiwitten leidt tot sterke activatie van ESX-4 en de productie van verschillende mogelijke toxines. Deze activatie is schadelijk voor de bacterie zelf.

In dit project onderzoek je de functie van deze mogelijke toxines. Daarnaast ontrafel je welk signaal en welk mechanisme verantwoordelijk zijn voor de inductie van ESX-4. Uiteindelijk willen we dit systeem ontregelen, waardoor de tuberculosebacterie zichzelf mogelijk vergiftigt.

We voeren dit onderzoek uit in samenwerking met de Radboud Universiteit, waar ook een PhD-kandidaat voor dit project wordt aangesteld. Het project wordt gefinancierd door NWO.

Je doet laboratoriumonderzoek naar de werking en regulatie van het ESX-4-systeem in pathogene mycobacteriën. Je werkzaamheden bestaan onder andere uit:

• Het uitvoeren van experimenten met bacteriële culturen.
• Het uitvoeren van genetische en moleculaire analyses.
• Het werken met microscopie.
• Het analyseren van data, waaronder proteomics- en transcriptomicsdata.
• Het bestuderen van eiwitten, waaronder mogelijke toxines.

Veel experimenten voer je uit met het modelorganisme Mycobacterium marinum. Daarnaast onderzoek je ook de tuberculosebacterie zelf, een BSL-3-organisme.

Voor deze PhD-positie zoeken we een onderzoeker met een sterke interesse in microbiologisch en biomoleculair onderzoek. Je neemt daarnaast het volgende mee:

• Een afgeronde masteropleiding in microbiologie, biomedische of biomoleculaire wetenschappen, biochemie of een vergelijkbare richting.
• Ervaring met moleculair-biologische en microbiologische technieken, zoals genetische manipulatie, eiwit- en DNA/RNA-analyse en het werken met bacteriële culturen.
• Een analytisch en zelfstandig werkvermogen. Je kunt complexe biologische vraagstukken systematisch onderzoeken en onderzoeksresultaten kritisch interpreteren.
• Goede communicatieve en samenwerkingsvaardigheden. Je beheerst de Nederlandse taal goed, zowel mondeling als schriftelijk, omdat je nauw samenwerkt met onderzoekers binnen en buiten Amsterdam UMC.
• Een sterke motivatie voor wetenschappelijk onderzoek en de bereidheid om nieuwe technieken en vaardigheden te leren.

Ervaring met M. tuberculosis of werken onder BSL-3-condities is geen vereiste. Wel verwachten we dat je bereid bent om deze vaardigheden te leren.

• Je treedt in dienst bij Amsterdam UMC Research BV.
• Een contract voor de duur van 12 maanden, met de intentie te verlengen tot een totaal van vier jaar. Voor deze vacature geldt de Richtlijn Promovendi.
• Inschaling in salarisschaal OIO: € 3.217 tot € 4.077 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van ervaring). Daarnaast ontvang je 8,3% eindejaarsuitkering. Bereken hier jouw netto salaris.
• Vakantie-uren: 194,4 uur per jaar bij een fulltime dienstverband en de mogelijkheid om uren bij te sparen.
• 100% OV-vergoeding. Kom je lopend, fietsend of met de auto? Dan ontvang je een vergoeding van €0,21 per km (voor de auto geldt een maximum van 40 km enkele reis).
• Kom je op de fiets? Maak gebruik van onze goede fietsregeling.
• Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.

Bekijk deze video met meer informatie over de indiensttreding bij Amsterdam UMC Research BV.

Medische Microbiologie en Infectiepreventie (MMI)

De afdeling MMI richt zich op de diagnostiek, behandeling en preventie van infectieziekten en infecties. De afdeling combineert patiëntenzorg met wetenschappelijk onderzoek naar microbiële ziekteverwekkers en antibioticaresistentie. Het tuberculose onderzoek vindt plaats in het O2 gebouw op de Zuidas en wordt gecoördineerd door Prof. Wilbert Bitter. In het O2 laboratorium werken momenteel 5 stafmedewerkers, 7 analisten en 16 promovendi, postdocs en gastonderzoekers.

Amsterdam UMC Research BV
Amsterdam UMC Research BV ondersteunt wetenschappelijk onderzoek zonder winstoogmerk. Hiermee voorzien we onderzoekers in alles wat ze nodig hebben om te kunnen excelleren. Zo bieden onze principal investigators (PI's) en projectleiders begeleiding op het gebied van projectbeheer, finance en human resources. Bij medisch-wetenschappelijke onderzoeksprojecten wordt daarnaast ook ondersteuning op juridisch vlak geboden.

Bekijk de video voor meer informatie.

We werken voor deze vacature samen met de Radboud Universiteit en de Vrije Universiteit. Leden van de gezamenlijke selectiecommissie kunnen daarom ook jouw sollicitatie inzien.

Sollicitaties worden doorlopend in behandeling genomen. Indien er een geschikte kandidaat gevonden is, wordt de vacature vroegtijdig gesloten.

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie over deze vacature kun je terecht bij Prof. Wilbert Bitter, hoogleraar medische microbiologie, via w.bitter@amsterdamumc.nl.

Een referentiecheck en screening kunnen onderdeel zijn van de procedure. Kom je bij ons in dienst, dan vragen we voor een aantal functiegroepen standaard een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag). Bekijk wat het inhoudt en of het voor jouw functie van toepassing is.

Interne kandidaten krijgen, bij gelijke geschiktheid, voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld.