Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in (Promotionsstelle) – Infektionsimmunologie und T-Zell-Erschöpfung (m/w/d)

Das Institut für Molekulare Medizin und Zellforschung sucht eine*n

Die Stelle dient der eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung durch Anfertigung einer Dissertation. Bearbeitet wird ein abgegrenztes Promotionsvorhaben zur Differenzierung, Funktion und Regulation erschöpfter T-Zellen in chronischen Infektionen, mit Schwerpunkt auf Antigenlast und TCR-Signalstärke / Progenitor- und Effektorsubpopulationen / transkriptionelle und epigenetische Programme / Reversibilität der Erschöpfung.

Aufgaben:

Bearbeitung des Promotionsvorhabens

• Durchführung der Experimente des Promotionsvorhabens nach Abstimmung mit der Betreuung; zunehmend eigenständige Planung im Verlauf der Qualifizierung
• zelluläre und molekulare Immunologie: Isolierung und Kultur primärer T-Zellen, adoptive Transfermodelle mit TCR-transgenen Zellen, Tetramer- und Multimerfärbungen, funktionelle Assays (Zytokinproduktion, Zytotoxizität, Proliferation, Restimulation)
• Multiparameter- bzw. Spektralzytometrie einschließlich Panel-Design, Kontrollen und Zellsortierung
• molekularbiologische Arbeiten: Klonierung, retro- oder lentivirale Transduktion primärer T-Zellen, CRISPR/Cas-basierte Editierung, qPCR, Proteinanalytik
• Probenvorbereitung für hochdimensionale Analysen (Einzelzell-Transkriptom- und TCR-Repertoire-Sequenzierung, Chromatin-Zugänglichkeitsanalysen) einschließlich Qualitätskontrolle
• Einarbeitung in neue Methoden und deren protokollgetreue Umsetzung; Erkennen und Melden von methodischen Problemen

Tierexperimentelle Arbeiten und Infektionsmodelle

• Durchführung der tierexperimentellen Arbeiten im Rahmen genehmigter Versuchsvorhaben und ausschließlich im Umfang der nachgewiesenen eigenen Sachkunde nach § 16 TierSchVersV; bis zu deren Nachweis nur unter Anwesenheit und Aufsicht einer qualifizierten Person
• Arbeit mit Modellen akuter und chronischer Infektion ([z. B. LCMV Armstrong und Klon 13, Listeria monocytogenes, VSV, Influenza, Tumormodelle]) einschließlich Infektion, Titerbestimmung und Verlaufskontrolle
• Belastungsbeurteilung anhand der festgelegten Score Sheets, strikte Einhaltung der Abbruchkriterien, unverzügliche Meldung von Auffälligkeiten an Versuchsleitung und Tierschutzbeauftragte
• Organ- und Probenentnahme, Aufbereitung und Weitergabe an die Analytik
• fachliche Zuarbeit zu Versuchsanträgen sowie Führung der vorgeschriebenen Aufzeichnungen zu den durchgeführten Versuchen

Auswertung, Dokumentation und Publikation

• Auswertung und statistische Analyse der eigenen Daten, einschließlich der Analyse hochdimensionaler Datensätze mit [R und/oder Python, FlowJo/OMIQ]
• lückenlose Führung des Laborbuchs bzw. der elektronischen Dokumentation und Sicherung der Rohdaten nach den Vorgaben der Einrichtung
• Literaturrecherche und Einordnung der eigenen Ergebnisse in den Forschungsstand
• Mitwirkung an Manuskripten mit dem Ziel einer Erstautorenschaft; Erstellung von Abbildungen und Methodenteilen
• Präsentation der Ergebnisse in Gruppenseminaren, Journal Clubs und auf Fachtagungen

Wissenschaftliche Qualifizierung

• Anfertigung der Dissertation nach der geltenden Promotionsordnung
• Teilnahme am Promotionsprogramm bzw. an der Graduiertenschule einschließlich der vorgesehenen Pflichtveranstaltungen und Berichte
• regelmäßige Treffen mit der Betreuung und dem Thesis Advisory Committee; Erstellung der Fortschrittsberichte
• Erwerb der versuchstierkundlichen Sachkunde nach § 16 TierSchVersV sowie der erforderlichen Sicherheits- und Methodenschulungen
• Besuch fachlicher und überfachlicher Weiterbildungen (Statistik, wissenschaftliches Schreiben, gute wissenschaftliche Praxis)

Labororganisation, Sicherheit und Mitwirkung in der Gruppe

• Pflege der zugeordneten Geräte und Arbeitsplätze, Bestandsführung von Reagenzien und Verbrauchsmaterial im zugewiesenen Rahmen
• Einhaltung der Vorgaben zu Schutzstufe [1/2], Gentechnik, Hygiene und Entsorgung; Teilnahme an den vorgeschriebenen Unterweisungen
• Übernahme von Gruppenaufgaben nach Absprache (z. B. Betreuung eines Gerätes, Bestellwesen, Organisation von Seminaren)
• Mitwirkung an Lehrveranstaltungen und Betreuung von Studierenden nur nach ausdrücklicher Übertragung und in geringem Umfang

Anforderungsprofil:

Formale Voraussetzungen

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Diplom, überdurchschnittlicher Abschluss) in Biologie, Biochemie, Biomedizin, Molekularer Medizin, Human- oder Veterinärmedizin oder einem verwandten Fach
• Erfüllung der Zulassungsvoraussetzungen der einschlägigen Promotionsordnung; Annahme als Doktorand*in (m/w/d) ist zeitnah nach Dienstantritt herbeizuführen
• Bereitschaft zum Erwerb der Sachkunde nach § 16 TierSchVersV mit den Kenntnissen und Fähigkeiten nach Anlage 1 Abschnitt 3 (versuchstierkundlicher Kurs, z. B. FELASA-Funktion [A/B] oder gleichwertig) vor Aufnahme eigenständiger tierexperimenteller Arbeiten
• Tätigkeit mit Krankheitserregern unter Aufsicht einer Erlaubnisinhaberin/eines Erlaubnisinhabers nach § 46 IfSG, soweit einschlägig

Fachliche Kompetenzen

• solide Grundkenntnisse der zellulären Immunologie, insbesondere der T-Zell-Biologie; Interesse an Infektionsimmunologie und T-Zell-Erschöpfung
• praktische Erfahrung in Zellkultur und Durchflusszytometrie aus Studium, Abschlussarbeit oder Praktika
• Grundkenntnisse molekularbiologischer Standardmethoden (PCR, Klonierung, Nukleinsäureisolierung)
• erste Erfahrung im Umgang mit Labornagern ist von Vorteil, aber keine Voraussetzung
• Grundkenntnisse in Statistik und Datenauswertung; Bereitschaft zur Einarbeitung in [R oder Python]
• gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Persönliche Kompetenzen

• ausgeprägte Lern- und Einsatzbereitschaft sowie Fähigkeit zu selbstständigem, strukturiertem Arbeiten nach Einarbeitung
• Sorgfalt und Ausdauer in langlaufenden Infektions- und Tierversuchen; Bereitschaft zu gelegentlichen Diensten außerhalb der Regelarbeitszeit nach Versuchsplan
• Verantwortungsbewusstsein im Umgang mit Versuchstieren und Belastbarkeit im tierexperimentellen Arbeiten
• Team- und Kommunikationsfähigkeit in einem internationalen Umfeld; Bereitschaft, Hilfe anzunehmen und Probleme frühzeitig anzusprechen

Die Stelle ist auf 18 Monate befristet in Teilzeit (70 %) zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach TV-L E13. Mit einer internen Bewerbung ist zu rechnen.

Prof. Dr. Dietmar Zehn

8161 71 3508